La Llotja està regida per una Junta Rectora formada per 12 membres elegits per sufragi universal dels adherits per parts iguals entre comerciants, industrials i agents comercials, i 3 membres designats per la Cambra Oficial de Comerç, Indústria i Navegació de Barcelona.
Actualment, els seus membres són :

President:
Aureli Casabona i Bel *
Vicepresident:
Josep M. Riera Roura
Tresorer:
Lluís Bou i Gelabert
Comptador:
Josep Ayneto i Peiron *
Vocals:
Víctor Blanc i Marfà
Josep Lluís Esteban i Mur
Raimon Domènech i Suñer
Joan Vallverdú i Simó
Josep M. Ricomà i Virgil *
Miquel Vila i Aymerich
Joaquim Garcia i Sánchez
Rosa Grau i Salas
Ramon Vilajosana i Capdevila
Josep M. Bonora i Dàsquens
Josep M. Torremorell i Mangues

* Designats per la Cambra Oficial de Comerç, Indústria i Navegació de Barcelona
L'òrgan suprem de govern és l'Assemblea General, que està constituïda per tots els adherits de més d'un any d'antiguitat que estiguin al corrent de pagament de la seva quota i no hagin estat sotmesos a expedient disciplinari que els inhabiliti a participar-hi.